BIÓLOGOS DE STANFORD DICEN DESCUBRIR LO QUE YA SABÍAMOS

Esto van a publicar, veremos a qué juegan esta vez.

A medida que recopilan y analizan cantidades masivas de secuencias genéticas de plantas, animales y microbios, los biólogos siguen “encontrando sorpresas”, dicen (impresionante la cara dura). La última es la que se informó esta semana en un preprint de un artículo científico, un nuevo tipo de entidad parecida a un “virus” que habita en bacterias de la boca y el intestino humanos. Estos "obeliscos", como los llama el equipo de la Universidad de Stanford, tienen genomas de ARN.

"Es una locura", dice Mark Peifer, biólogo celular y del desarrollo de la Universidad de Carolina del Norte, “Cuanto más miramos, más locuras vemos".

Desde luego querido. “Aún no se sabe si los obeliscos afectan la salud humana”, afirma Matthew Sullivan, biólogo de la Universidad de Ohio, pero podrían alterar la actividad genética de sus huéspedes bacterianos, lo que a su vez podría afectar a los genes humanos. Ya tienen la excusa.

La gente conoce al ARN como el alter ego del ADN: transporta recetas de producción de proteínas codificadas en un gen basado en el ADN a “cocinas” moleculares fuera del núcleo celular que unen los aminoácidos de una proteína. Pero más de 200 “virus” tienen “genomas” compuestos únicamente por ARN. A principios del siglo XX, los biólogos se encontraron con los viroides, básicamente un bucle de ARN sin la cubierta proteica. Al parecer, los genomas de viroides no codifican ninguna proteína. Los viroides han despertado mucho interés porque interactúan con los genomas de las plantas, a veces de manera devastadora: provocan retraso del crecimiento y deformación en patatas, crisantemos y otros cultivos, por ejemplo.

Durante mucho tiempo se pensó que los viroides se limitaban a las plantas, pero recientemente ha habido alguna evidencia de genomas de ARN circulares similares a los viroides en bases de datos de secuencias de animales y bacterias. En una nueva búsqueda de genomas de ARN no descubiertos, el biólogo de Stanford Andrew Fire y sus colegas desarrollaron un software para analizar catálogos de genes activos de microbios que viven en humanos en busca de secuencias de ARN que se predice que formarán círculos: la estructura del material genético tanto en “virus” como en viroides. "Estoy realmente impresionado por el enfoque", dice el biólogo computacional Simon Roux del Joint Genome Institute en el Lawrence Berkeley, quien trabajó en un artículo de 2023 que insinuaba que las bacterias podrían contener viroides o entidades similares.

La búsqueda de Stanford arrojó casi 30.000 círculos de ARN predichos, cada uno de los cuales constaba de unas 1.000 bases y probablemente representaba un obelisco distinto. El equipo concluyó que era poco probable que fueran “virus auténticos”, porque los “virus” de ARN suelen tener muchas más bases. Pero algunas de las secuencias del obelisco codificaban proteínas implicadas en la replicación del ARN, lo que las hacía más complejas que los viroides estándar. Sin embargo, al igual que los viroides, los obeliscos no parecen codificar proteínas que forman una concha. Roux dice que se necesita más trabajo para ver qué tan distintos son los obeliscos de los viroides y otras partículas similares a los viroides. Entre las bases de datos microbianas humanas examinadas, se encontraron secuencias de obelisco en el 7% de las bacterias intestinales humanas y en la mitad de las bacterias de la boca humana. Y los obeliscos en los microbios de diferentes partes del cuerpo tienen secuencias distintivas, informan Fire y sus colegas en su preimpresión, que se publicó el 21 de enero en bioRxiv.

Los obeliscos contienen genes que no se parecen a ninguno de los descubiertos hasta ahora en otros organismos, "comprenden clases de ARN que han colonizado y pasado inadvertidos en los microbiomas humanos y globales", escribe el equipo. "Creo que este trabajo es una indicación más clara de que todavía estamos explorando las fronteras de este universo viral", dice Roux, quien también está buscando nuevos tipos de entidades similares a “virus” y ha ayudado a compilar una base de datos de más de 15 millones. Lo que me parece alucinante, es que sigan dándole vueltas al concepto obsoleto de “virus”, mientras descubren exactamente lo que explico en mi libro “Yo, Negacionista”, que tales entes no son sino partes de nosotros mismos, exosomas mensajeros. Ahora fingen “descubrir” obeliscos, los rebautizan como algo nuevo en lugar de reconocer el inmenso error que arrastran casi dos siglos. No hay tales virus, ni llamen obeliscos a lo que sabemos que existía hace mucho. En el fondo es otra victoria, reconocen que somos esos “virus”, nada más que información genética trasponible. Pero como siempre digo, algo existe si lo nombras, crean nuevo palabro para lo que ya se sabía.

Fernando López-Mirones
(https://t.me/elaullido)